La principal misión de Econatur es la innovación continua y la aplicación del conocimiento científico y biotecnológico en un modelo de agricultura sostenible.
Desde Innovación, se investigan otras áreas de actividad como la producción de ingredientes y principios activos para agricultura, para la industria alimentaria y en el futuro para cosmética y farmacia. También se abordan proyectos de Industria 4.0 co-desarrollando tecnologías diseñadas para asegurar la trazabilidad alimentaria y el tratamiento de datos.